Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGA1Q9UJY5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms