Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDUFA12Q9UI09 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDUFA12Q9UI09 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms