Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCSK1NQ9UHG2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PCSK1NQ9UHG2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PCSK1NQ9UHG2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCSK1NQ9UHG2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCSK1NQ9UHG2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCSK1NQ9UHG2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCSK1NQ9UHG2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCSK1NQ9UHG2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms