Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms