Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLKQ9UBT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms