Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms