Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKD2L1Q9P0L9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms