Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCMF1Q9P0J7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms