Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms