Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A4Q9NY91 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A4Q9NY91 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms