Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TOR4AQ9NXH8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms