Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYRM2Q9NU23 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYRM2Q9NU23 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYRM2Q9NU23 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYRM2Q9NU23 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYRM2Q9NU23 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYRM2Q9NU23 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYRM2Q9NU23 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYRM2Q9NU23 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYRM2Q9NU23 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms