Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms