Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms