Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TM7SF3Q9NS93 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms