Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms