Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM5Q9NQX1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM5Q9NQX1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM5Q9NQX1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM5Q9NQX1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM5Q9NQX1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM5Q9NQX1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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