Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms