Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY9Q9HBG7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms