Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms