Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms