Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDGFDQ9GZP0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDGFDQ9GZP0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms