Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms