Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CELF4Q9BZC1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms