Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms