Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5DQ9BY66 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms