Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC46A2Q9BY10 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC46A2Q9BY10 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms