Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms