Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP2Q9BX26 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms