Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP1Q9BWH6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP1Q9BWH6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms