Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SSBP4Q9BWG4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SSBP4Q9BWG4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SSBP4Q9BWG4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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