Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAIPQ9BWF2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAIPQ9BWF2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAIPQ9BWF2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms