Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms