Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCMBPQ9BTE3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms