Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA3Q9BTC8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms