Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms