Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GABRG3Q99928 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRG3Q99928 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms