Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms