Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAT1Q99536 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms