Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms