Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MYCBPQ99417 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MYCBPQ99417 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms