Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms