Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT140Q96RY7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT140Q96RY7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms