Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms