Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGS1Q96RS0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGS1Q96RS0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGS1Q96RS0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGS1Q96RS0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGS1Q96RS0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGS1Q96RS0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGS1Q96RS0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms