Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TEFMQ96QE5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms