Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms