Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC85AQ96PX6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms