Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNGAP1Q96PV0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms