Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRD1AQ96P16 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms